Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPAG9O60271 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPAG9O60271 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms