Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CREB3O43889 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CREB3O43889 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB3O43889 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms