Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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HOXA3O43365 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HOXA3O43365 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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