Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F3O00716 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F3O00716 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms