Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC01387J3KSC0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms