Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
B4DXG7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
B4DXG7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
B4DXG7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms