Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LINC00587B1AMM8 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms