Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VGLL3A8MV65 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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