Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms