Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FRMD3A2A2Y4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms