Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX8Q9Y5X2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX8Q9Y5X2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms