Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MED16Q9Y2X0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms