Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAK1Q9UPV9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAK1Q9UPV9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms