Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SETD1BQ9UPS6 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms