Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNRF3Q9ULT6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms