Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEFF2Q9UIK5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMEFF2Q9UIK5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms