Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms