Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLKQ9UBT6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms