Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VPS29Q9UBQ0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms