Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms