Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIRT3Q9NTG7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms