Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CYP4F12Q9HCS2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms