Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP29Q9HBJ7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP29Q9HBJ7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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