Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSPNQ9HAW4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSPNQ9HAW4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms