Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GPR88Q9GZN0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GPR88Q9GZN0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms