Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCSER1Q9C0I3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCSER1Q9C0I3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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