Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF6Q9BYE7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms