Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VN1R3Q9BXE9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms