Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYCP2Q9BX26 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYCP2Q9BX26 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms