Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC94Q9BW85 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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