Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFHD1Q9BUP0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms