Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TMEM208Q9BTX3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms