Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms