Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CRBNQ96SW2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms