Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCNL2Q96S94 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms