Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GCNAQ96QF7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms