Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB3IPQ96QF0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms