Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00526Q96FQ7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms