Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms