Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USP9XQ93008 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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USP9XQ93008 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
USP9XQ93008 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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