Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTPRUQ92729 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms