Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HERVK_113Q902F9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HERVK_113Q902F9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms