Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC155Q8N6L0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms