Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms