Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYT9Q86SS6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SYT9Q86SS6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SYT9Q86SS6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SYT9Q86SS6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYT9Q86SS6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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