Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR53Q7Z5U6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms