Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TCF23Q7RTU1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TCF23Q7RTU1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms