Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTF1AQ7RTS3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms