Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC80Q76M96 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms