Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXD4L3Q6VB84 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms